虚拟载玻片在硅藻检验中的应用
通过光学显微镜识别和计数硅藻是生态和水质调查的基本方法。在这里,科学家提出了一种基于“数字虚拟载玻片”的新方法,并将其与传统的非数字化光学显微镜工作流程进行比较。他们使用两种方法分析了六个样品的三个重复:1) 直接在光学显微镜上工作(“传统”计数方法),以及 2) 通过高分辨率载玻片扫描制备“虚拟数字载玻片”,然后识别和标记单个硅藻或使用基于 Web 浏览器的图像注释平台(数字方法)的 frustules。
两种方法在物种丰富度、硅藻指数和硅藻群落组成方面都产生了可比的结果。虽然用数字显微镜计数稍微费时,经验表明,数字化工作流程不仅可以提高硅藻计数的透明度和可重复使用性,还可以提高分类精度。引入的数字工作流程还可用于通过网络进行分类学专家间校准,并为基于深度学习的硅藻识别生成训练图像集,使其成为传统光学显微镜硅藻分析的有前途和通用的替代方案或扩展。
Burfeid-Castellanos, A.M.; Kloster, M.; Beszteri, S.; Postel, U.; Spyra, M.; Zurowietz, M.; Nattkemper, T.W.; Beszteri, B. A Digital Light Microscopic Method for Diatom Surveys. Preprints 2022, 2022090203 (doi: 10.20944/preprints202209.0203.v1).
Burfeid-Castellanos,上午;克洛斯特,M。贝斯特里,S。美国邮政总局;斯派拉,M。祖罗维茨,M.;纳特肯珀,台湾;Beszteri, B. 一种用于硅藻调查的数字光学显微方法。预印本 2022、2022090203(doi:10.20944/preprints202209.0203.v1)。